Vorgehen zur Etablierung ZELLTOX-Workflow
Beim Treffen am 25.08. mit Rita, @koenigm, @remmlerp und Hannes wurde folgende Schritte beschlossen:
- für generelle Datenspeicherung der Bilder und Metadaten-DB wird ein extra Projektlaufwerk empfohlen
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Maria reicht Antrag ein (5565) -
Florian bindet dieses Projektlaufwerk am ImageXPress-Rechner -
Florian konfiguriert die ImageXPress-Software, dass diese die Daten auf dem Projektlaufwerk speichert
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- für den Import in OMERO
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für Omero freigegebene Daten wird ein extra Ordner auf diesem Projektlaufwerk eingerichtet -
Hannes richtet einen Mount von dem Omero-Ordner auf dem Omero-Server ein (für späteren Import) -
Maria stellt möglichst vollständige Beispielmetadaten zusammen -
Hannes passt das Importskript an die Metadaten/Bilder an -
Automatisierung wurde eingerichtet
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- für Langzeitarchivierung (bei Fragen an Paul wenden)
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Maria überlegt sich den Umfang der zu archivierenden Daten -
Festlegung Archivierungsintervall -
Erstellung der Archiv-Metadatendatei -
Automatisierung
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Edited by Hannes Bohring