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Vorgehen zur Etablierung ZELLTOX-Workflow

Beim Treffen am 25.08. mit Rita, @koenigm, @remmlerp und Hannes wurde folgende Schritte beschlossen:

  • für generelle Datenspeicherung der Bilder und Metadaten-DB wird ein extra Projektlaufwerk empfohlen
    • Maria reicht Antrag ein (5565)
    • Florian bindet dieses Projektlaufwerk am ImageXPress-Rechner
    • Florian konfiguriert die ImageXPress-Software, dass diese die Daten auf dem Projektlaufwerk speichert
  • für den Import in OMERO
    • für Omero freigegebene Daten wird ein extra Ordner auf diesem Projektlaufwerk eingerichtet
    • Hannes richtet einen Mount von dem Omero-Ordner auf dem Omero-Server ein (für späteren Import)
    • Maria stellt möglichst vollständige Beispielmetadaten zusammen
    • Hannes passt das Importskript an die Metadaten/Bilder an
    • Automatisierung wurde eingerichtet
  • für Langzeitarchivierung (bei Fragen an Paul wenden)
    • Maria überlegt sich den Umfang der zu archivierenden Daten
    • Festlegung Archivierungsintervall
    • Erstellung der Archiv-Metadatendatei
    • Automatisierung
Edited by Hannes Bohring